Najcenniejsze zabytki Włocławka są objęte ochroną poprzez wpis do rejestru zabytków na podstawie decyzji wydanej przez właściwego wojewódzkiego konserwatora zabytków. Jest to najbardziej powszechna i najściślejsza z przewidzianych w polskim prawie form ochrony zabytków.
Obecnie w granicach administracyjnych miasta Włocławek znajduje się 70 obiektów zabytkowych wpisanych do księgi rejestru zabytków województwa kujawsko-pomorskiego, prowadzonego przez Kujawsko-Pomorskiego Wojewódzkiego Konserwatora Zabytków w Toruniu.